#1
Wat?
Niet echt een easter egg, dan wel de mogelijkheid om binnen de extra's makkelijk te kunnen switchen tussen het Brotherhood of Mutants-menu en het X-Men menu.

Hoe?
In het features-menu staat in het "Brotherhood of Mutants"-menu bovenaan het X-Men logo en vice versa.

#2
Wat?
Een promotionele scène die uiteindelijk niet gebruikt werd, waarin de X-jet landt voor het Witte Huis.

Hoe?
Op disc 1, in het "Brotherhood of Mutants"-menu, ga naar de verwijderde scènes en daarbinnen naar het laatste scherm. Ga naar "extended Dark Phoenix destruction" en druk op het pijltje naar boven. Het X-symbool licht op. Druk op enter.
Of: Op disc 1, in het "X-Men"-menu, ga naar de verwijderde scènes en daarbinnen naar het laatste scherm. Ga naar "Beast breaks a neck" en druk op het pijltje naar boven. Het Brotherhood of Mutants-symbool licht op. Druk op enter.